MTGアリーナでワイルドカードとは、同じレアリティの他のカードと交換できるカードを指します。ワイルドカードはブースターパックで入手することができ、コモン、アンコモン、レア、神話レアのすべてのレアリティで用意されています。すでに4枚所持しているコモンやアンコモンを入手すると、宝箱の進行度が上がります。宝箱が100％になると、ワイルドカード（アンコモン3枚、レア2枚、神話1枚）も手に入ります。
ワイルドカードを任意のカードに替える方法は複数あります。
- すでにカードを持っている場合は、最初にワイルドカード・ボタンをクリックしなくても、コレクション内でカードをクリックするだけで構いません。
- カードを持っていない場合は、フィルターを「未所持（Not Collected）」のカードを含むように変更し、カードを検索してからクリックしてください。
- デッキの編集中に所持している量より多くのカードをデッキに追加しようとすると、そのカードに使用するワイルドカードを取得するよう求められます。
- 所持していないカードを含むデッキをインポートした場合、デッキ編集の「完了（Done）」ボタンの脇にある「すべて作成（Craft All）」ボタンを使って、足りないカードをすべて作ることができます。
クライアントの上部にあるワイルドカードアイコンをマウスオーバーすると、現在持っている各レアリティのワイルドカードの数を確認することができます。